Ο πρώτος που θα συναντήσετε είναι ο ναός της Κοιμήσεως της Θεοτόκου ή της Παναγίας του Παπαμελετίου χτισμένη πάνω σε απότομο βράχο. Είναι κτίσμα του 17ου αιώνα. Η στέγη της είναι φτιαγμένη από σχιστολιθικές πλάκες.
Στη βόρεια πλευρά του ναού είναι προσκολλημένο μονόκλιτο παρεκκλήσιο των Αγίων Αναργύρων μετά τρούλου. Στο ναό υπάρχουν αρκετές εικόνες του 17ου, 18ου και 19ου αιώνα.
Ο ναός του Αγίου Νικολάου είναι χτισμένος στη θέση παλιότερου ναού από τον οποίο έχει διατηρήσει το ξυλόγλυπτο τέμπλο. Κι εδώ βλέπουμε εικόνες του 17ου, του 18ου, και του 19ου αιώνα. Ο ναός του Αγίου Αθανασίου του εν τω 'Αθω ή Αινάθωνας. Κτίσμα του 9ου αιώνα οικοδομημένο πάνω σε ερείπια πρωτοχριστιανικού ναού και βρίσκεται μέσα στο Κάστρο της χώρας που είναι ερείπιο του Ενετικού φρουρίου.
Ο ναός του Αγίου Μιχαήλ Συννάδων, θα τον συναντήσετε κοντά στην Εμπορική Τράπεζα. Είναι μια πέτρινη εκκλησία με στέγη από σχιστολιθικές πλάκες. Εδώ έχουν καταγραφεί 24 εικόνες του 17ου και 18ου αιώνα και στην αψίδα του Ιερού είναι εντοιχισμένη επιτύμβιος στήλη.
Ο ναός του Χριστού (Μητροπολιτικός ναός) με ξυλόγλυπτο τέμπλο μοναδικής τέχνης και αξίας με τις μορφές των προφητών και των Αποστόλων που επιχρυσώθηκε το 1762. Στην αυλή του υπάρχουν τάφοι παλιών επισκόπων.
Ο ναός του Αγίου Δημητρίου. Μικρός ναός με τοιχογραφίες του 17ου αιώνα. Ο ναός του Αγ. Γεωργίου του Κυρατσού. Με δάπεδο στρωμένο με χαλίκι. Στο ξυλόγλυπτο τέμπλο υπάρχει η Μεγάλη Δέηση με τους 12 Αποστόλους και εικόνες του 16ου, 17ου, και 18ου αιώνα.
Η Βασιλική των Αγίων Αποστόλων, πάνω από το Δημαρχείο που την έκτισε τον αιώνα ο Επίσκοπος Αναστάσιος. Άλλες αξιόλογες εκκλησίες είναι ο ναός της Φανερωμένης απέναντι από το Λαογραφικό Μουσείο και ο ναός της Παναγιάς της Ελευθερώτριας πριν από το κτίριο του συνεταιρισμού, ο ναός του Αγίου Νικολάου των Κήπων, ο ναός των Εισοδίων της Θεοτόκου.

Το εκκλησάκι του Αγίου Ιωάννη βρίσκεται στην κορυφή θαλασσόβραχου με ύψος 100 μ. Δυστυχώς δεν υπάρχουν σαφείς πληροφορίες για το πότε ακριβώς χτίστηκε αυτό το εκκλησάκι.
Η ιστορία των ντόπιων λέει ότι ένα βράδυ κάποιος κάτοικος του νησιού διέκρινε μία λάμψη στην κορυφή του βράχου. Στην αρχή ο κάτοικος δεν έδωσε ιδιαίτερη σημασία. Αυτό επαναλαμβανόταν για αρκετά βράδια μέχρι που ο Σκοπελίτης είδε στο όνειρο του μία γυναίκα που του είπε να ανέβει στην κορυφή του βράχου μαζί με τους υπόλοιπους κατοίκους του νησιού γιατί εκεί υπήρχε μία εικόνα. Έτσι κι έγινε. Ο Σκοπελίτης την επόμενη μέρα κάλεσε όλους τους κατοίκους του νησιού και αφού τους είπε τι έχει συμβεί ξεκίνησαν να σκαλίζουν σκαλοπάτια πάνω στο βράχο για να καταφέρουν να φτάσουν στην κορυφή του. Όταν τα κατάφεραν και ανέβηκαν πάνω στο βράχο βρήκαν μία εικόνα του Άγιου Ιωάννη την οποία και μετέφεραν σε ένα κοντινό εκκλησάκι. Την επόμενη μέρα ανακάλυψαν ότι εικόνα δεν βρισκόταν πια στην εκκλησία αλλά στην πρωταρχική της θέση και έτσι αποφάσισαν να χτίσουν ένα εκκλησάκι πάνω στο βράχο γιατί όπως έλεγαν ο Άγιος Ιωάννης ήθελε να μείνει εκεί.  
Για να φτάσει κανείς στον Άη Γιάννη πρέπει να ανεβεί τα 105 σκαλοπάτια που έχουν λαξευτεί στο βράχο. Στο βιβλίο των επισκεπτών μπορεί να αφήσει τις εντυπώσεις του για την κατανυκτική ατμόσφαιρα της εκκλησιάς και την μαγευτική θέα από το προαύλιο. Επίσης μπορεί να απολαύσει την όμορφη παραλία με τα καταγάλανα νερά που υπάρχει εκεί.

Το Μοναστήρι του Αγίου Ρηγίνου βρίσκεται 2 χλμ βορειοδυτικά της πόλης της Σκοπέλου. Η Μονή κτίσθηκε πάνω στα ερείπια βυζαντινού ναού σύμφωνα με επιγραφή το 1728. Στην αυλή του μοναστηριού υπάρχει ο τάφος του Αγίου Ρηγίνου. Είναι μία μικρή σαρκοφάγος που χρονολογείται από τον 4ο αιώνα μ.Χ.
Ο Άγιος Ρηγίνος είναι ο πολιούχος της Σκοπέλου και ο πρώτος επίσκοπος. Στο παλιό γεφυράκι όπου υπάρχει το εικονοστάσι του, αποκεφαλίστηκε ο μάρτυρας Ρηγίνος το 362μ.Χ. γιατί δεν άλλαξε την πίστη του. Οι Σκοπελίτες τον γιορτάζουν με λαμπρότητα  κάθε χρόνο στις 25 Φεβρουαρίου.
Σήμερα η Μονή Ανήκει στον Δήμο Σκοπέλου και κατά τους καλοκαιρινούς μήνες είναι ανοιχτή όλη μέρα για όλους τους πιστούς που θέλουν να προσκυνήσουν.

Το μοναστήρι του Ευαγγελισμού που βρίσκεται απέναντι από την πόλη της Σκοπέλου το οποίο ανήκει στη Μονή Ξηροποτάμου του Αγίου Όρους και που εκεί θα έχετε την ευκαιρία να θαυμάσετε μια σπάνια έκθεση από εικόνες, διάφορα σκεύη και πανέμορφα υφαντά. Είναι ένα από τα πολλά βυζαντινά μνημεία και απέχει 3,5 χλμ από τη Σκόπελο. Έχει υπέροχη θέα προς την πόλη και είναι κτισμένη σε δύσβατη πλευρά φαραγγιού. Η Μονή συνδέεται με τη μεγάλη και πλούσια οικογένεια Δαπόντε κι αυτό το επιβεβαιώνει η μεγάλη πλάκα που υπάρχει εκεί με την επιγραφή και το όνομα του Δαπόντε, το τέμπλο που έχει δωρίσει η οικογένεια Δαπόντε και ο Επισκοπικός θρόνος. Υπάρχουν επίσης πολλά ξυλόγλυπτα και πολύ σπουδαίες εικόνες του 16ου, 17ου και 18ου αιώνα.

Η Μονή του Τιμίου Προδρόμου βρίσκεται δίπλα από το μοναστήρι της Αγίας Βαρβάρας και απέναντι από την πρωτεύουσα της Σκοπέλου. Είναι και αυτό από τα λίγα κατοικημένα μοναστήρια του νησιού, και οι μοναχές που μένουν εκεί είναι πάντα πρόθυμες να ξεναγήσουν κάθε επισκέπτη στη Μονή.  Όπως αναφέρεται σε μία επιγραφή που υπάρχει στην είσοδο της Μονής, η Μονή ανακαινίστηκε από τα θεμέλια το 1721 από τον ιερομόναχο Φιλάρετο.  
Ενδιαφέρον παρουσιάζουν οι εικόνες της, οι οποίες χρονολογούνται του 16ου, 17ου και 18ου αιώνα, το επίχρυσο ξυλόγλυπτο τέμπλο του καθολικού με πλούσιο διάκοσμο από πουλιά, ζώα και φυτά όπως και μία τοιχογραφία που υπάρχει στην τράπεζα της Μονής με θέμα την ίδρυση της Μονής.

Η εκκλησία της Επισκοπής βρίσκεται 10 λεπτά από την πρωτεύουσα του νησιού στο εσωτερικό του συγκροτήματος της Επισκοπής.
Πρόκειται για μία μονόκλιτη βασιλική του 17ου αιώνα η οποία είναι χτισμένη πάνω σε παλαιοχριστιανικό ναό ο οποίος με τη σειρά του ήταν χτισμένος πάνω σε ένα αρχαίο ιερό.
Το όλο ενετικό κτίσμα προοριζόταν για να γίνει η έδρα του Επισκόπου της Σκοπέλου αλλά δεν τελειοποιήθηκε ποτέ λόγω των επιδρομών του πειρατή Μπαρμπαρόσα.